Voici les principales unités de recherche où l’on retrouve les professeurs du Département des sciences économiques :
- Centre interuniversitaire de recherche en analyse des organisations (CIRANO)
- Centre interuniversitaire de recherche en économie quantitative (CIREQ)
- Centre sur l'innovation, la performance et le bien-être dans l'économie du savoir
- Chaire de recherche sur les enjeux économiques intergénérationnels (CREEi)
- Chaire en macroéconomie et prévisions
- Développement économique et inégalités des territoires (DEIT)
- Groupe de recherche en capital humain
- Institut des sciences de l’environnement